Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUV7

SPTLC3, Serine palmitoyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC3Q9NUV7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPTLC3Q9NUV7 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms