Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FOXD4L1Q9NU39 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXD4L1Q9NU39 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms