Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HELLSQ9NRZ9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms