Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRQ5

SMCO4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO4Q9NRQ5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMCO4Q9NRQ5 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMCO4Q9NRQ5 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMCO4Q9NRQ5 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMCO4Q9NRQ5 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMCO4Q9NRQ5 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMCO4Q9NRQ5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMCO4Q9NRQ5 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMCO4Q9NRQ5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMCO4Q9NRQ5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMCO4Q9NRQ5 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMCO4Q9NRQ5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMCO4Q9NRQ5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMCO4Q9NRQ5 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMCO4Q9NRQ5 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMCO4Q9NRQ5 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMCO4Q9NRQ5 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SMCO4Q9NRQ5 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SMCO4Q9NRQ5 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO4Q9NRQ5 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms