Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms