Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQR4

NIT2, Omega-amidase NIT2, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIT2Q9NQR4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIT2Q9NQR4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms