Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HMG20AQ9NP66 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HMG20AQ9NP66 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HMG20AQ9NP66 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMG20AQ9NP66 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms