Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAV7

GRPEL1, GrpE protein homolog 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRPEL1Q9HAV7 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRPEL1Q9HAV7 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRPEL1Q9HAV7 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRPEL1Q9HAV7 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRPEL1Q9HAV7 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRPEL1Q9HAV7 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRPEL1Q9HAV7 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRPEL1Q9HAV7 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRPEL1Q9HAV7 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRPEL1Q9HAV7 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRPEL1Q9HAV7 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRPEL1Q9HAV7 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRPEL1Q9HAV7 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRPEL1Q9HAV7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRPEL1Q9HAV7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRPEL1Q9HAV7 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRPEL1Q9HAV7 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRPEL1Q9HAV7 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GRPEL1Q9HAV7 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRPEL1Q9HAV7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRPEL1Q9HAV7 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRPEL1Q9HAV7 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRPEL1Q9HAV7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRPEL1Q9HAV7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRPEL1Q9HAV7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRPEL1Q9HAV7 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRPEL1Q9HAV7 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRPEL1Q9HAV7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GRPEL1Q9HAV7 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRPEL1Q9HAV7 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRPEL1Q9HAV7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRPEL1Q9HAV7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRPEL1Q9HAV7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRPEL1Q9HAV7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRPEL1Q9HAV7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRPEL1Q9HAV7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRPEL1Q9HAV7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRPEL1Q9HAV7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRPEL1Q9HAV7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRPEL1Q9HAV7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRPEL1Q9HAV7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRPEL1Q9HAV7 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRPEL1Q9HAV7 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRPEL1Q9HAV7 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRPEL1Q9HAV7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRPEL1Q9HAV7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GRPEL1Q9HAV7 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRPEL1Q9HAV7 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
GRPEL1Q9HAV7 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRPEL1Q9HAV7 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRPEL1Q9HAV7 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRPEL1Q9HAV7 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRPEL1Q9HAV7 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRPEL1Q9HAV7 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRPEL1Q9HAV7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRPEL1Q9HAV7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRPEL1Q9HAV7 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRPEL1Q9HAV7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRPEL1Q9HAV7 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRPEL1Q9HAV7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GRPEL1Q9HAV7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRPEL1Q9HAV7 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRPEL1Q9HAV7 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRPEL1Q9HAV7 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRPEL1Q9HAV7 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRPEL1Q9HAV7 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRPEL1Q9HAV7 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRPEL1Q9HAV7 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GRPEL1Q9HAV7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRPEL1Q9HAV7 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRPEL1Q9HAV7 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRPEL1Q9HAV7 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRPEL1Q9HAV7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRPEL1Q9HAV7 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRPEL1Q9HAV7 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRPEL1Q9HAV7 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRPEL1Q9HAV7 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRPEL1Q9HAV7 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRPEL1Q9HAV7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRPEL1Q9HAV7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRPEL1Q9HAV7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRPEL1Q9HAV7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRPEL1Q9HAV7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GRPEL1Q9HAV7 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRPEL1Q9HAV7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRPEL1Q9HAV7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRPEL1Q9HAV7 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRPEL1Q9HAV7 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRPEL1Q9HAV7 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRPEL1Q9HAV7 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRPEL1Q9HAV7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRPEL1Q9HAV7 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRPEL1Q9HAV7 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRPEL1Q9HAV7 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRPEL1Q9HAV7 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRPEL1Q9HAV7 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRPEL1Q9HAV7 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRPEL1Q9HAV7 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRPEL1Q9HAV7 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRPEL1Q9HAV7 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms