Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms