Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDGFDQ9GZP0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDGFDQ9GZP0 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDGFDQ9GZP0 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDGFDQ9GZP0 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDGFDQ9GZP0 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDGFDQ9GZP0 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDGFDQ9GZP0 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDGFDQ9GZP0 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDGFDQ9GZP0 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDGFDQ9GZP0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDGFDQ9GZP0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDGFDQ9GZP0 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDGFDQ9GZP0 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDGFDQ9GZP0 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDGFDQ9GZP0 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDGFDQ9GZP0 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDGFDQ9GZP0 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDGFDQ9GZP0 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDGFDQ9GZP0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
PDGFDQ9GZP0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDGFDQ9GZP0 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDGFDQ9GZP0 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDGFDQ9GZP0 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDGFDQ9GZP0 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDGFDQ9GZP0 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PDGFDQ9GZP0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDGFDQ9GZP0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDGFDQ9GZP0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PDGFDQ9GZP0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDGFDQ9GZP0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDGFDQ9GZP0 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDGFDQ9GZP0 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDGFDQ9GZP0 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDGFDQ9GZP0 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDGFDQ9GZP0 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDGFDQ9GZP0 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDGFDQ9GZP0 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDGFDQ9GZP0 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDGFDQ9GZP0 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDGFDQ9GZP0 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PDGFDQ9GZP0 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDGFDQ9GZP0 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDGFDQ9GZP0 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDGFDQ9GZP0 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDGFDQ9GZP0 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PDGFDQ9GZP0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDGFDQ9GZP0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDGFDQ9GZP0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDGFDQ9GZP0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDGFDQ9GZP0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDGFDQ9GZP0 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDGFDQ9GZP0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDGFDQ9GZP0 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDGFDQ9GZP0 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDGFDQ9GZP0 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDGFDQ9GZP0 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDGFDQ9GZP0 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDGFDQ9GZP0 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDGFDQ9GZP0 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDGFDQ9GZP0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PDGFDQ9GZP0 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDGFDQ9GZP0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDGFDQ9GZP0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDGFDQ9GZP0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDGFDQ9GZP0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDGFDQ9GZP0 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDGFDQ9GZP0 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDGFDQ9GZP0 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDGFDQ9GZP0 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDGFDQ9GZP0 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDGFDQ9GZP0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDGFDQ9GZP0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDGFDQ9GZP0 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDGFDQ9GZP0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDGFDQ9GZP0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDGFDQ9GZP0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDGFDQ9GZP0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDGFDQ9GZP0 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDGFDQ9GZP0 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDGFDQ9GZP0 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDGFDQ9GZP0 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDGFDQ9GZP0 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDGFDQ9GZP0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDGFDQ9GZP0 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDGFDQ9GZP0 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDGFDQ9GZP0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDGFDQ9GZP0 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDGFDQ9GZP0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDGFDQ9GZP0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDGFDQ9GZP0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDGFDQ9GZP0 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDGFDQ9GZP0 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PDGFDQ9GZP0 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDGFDQ9GZP0 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDGFDQ9GZP0 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDGFDQ9GZP0 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDGFDQ9GZP0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDGFDQ9GZP0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDGFDQ9GZP0 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms