Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K0

BCL11B, B-cell lymphoma/leukemia 11B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL11BQ9C0K0 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BCL11BQ9C0K0 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BCL11BQ9C0K0 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BCL11BQ9C0K0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BCL11BQ9C0K0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BCL11BQ9C0K0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BCL11BQ9C0K0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BCL11BQ9C0K0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BCL11BQ9C0K0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BCL11BQ9C0K0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BCL11BQ9C0K0 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BCL11BQ9C0K0 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BCL11BQ9C0K0 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BCL11BQ9C0K0 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BCL11BQ9C0K0 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
BCL11BQ9C0K0 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BCL11BQ9C0K0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BCL11BQ9C0K0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BCL11BQ9C0K0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
BCL11BQ9C0K0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BCL11BQ9C0K0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BCL11BQ9C0K0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BCL11BQ9C0K0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BCL11BQ9C0K0 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BCL11BQ9C0K0 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BCL11BQ9C0K0 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BCL11BQ9C0K0 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BCL11BQ9C0K0 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BCL11BQ9C0K0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BCL11BQ9C0K0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BCL11BQ9C0K0 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BCL11BQ9C0K0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BCL11BQ9C0K0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BCL11BQ9C0K0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BCL11BQ9C0K0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BCL11BQ9C0K0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BCL11BQ9C0K0 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
BCL11BQ9C0K0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BCL11BQ9C0K0 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BCL11BQ9C0K0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
BCL11BQ9C0K0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BCL11BQ9C0K0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BCL11BQ9C0K0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BCL11BQ9C0K0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BCL11BQ9C0K0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BCL11BQ9C0K0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BCL11BQ9C0K0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BCL11BQ9C0K0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BCL11BQ9C0K0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BCL11BQ9C0K0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BCL11BQ9C0K0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BCL11BQ9C0K0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BCL11BQ9C0K0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BCL11BQ9C0K0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BCL11BQ9C0K0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BCL11BQ9C0K0 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BCL11BQ9C0K0 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BCL11BQ9C0K0 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BCL11BQ9C0K0 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BCL11BQ9C0K0 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BCL11BQ9C0K0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BCL11BQ9C0K0 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BCL11BQ9C0K0 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BCL11BQ9C0K0 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
BCL11BQ9C0K0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
BCL11BQ9C0K0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
BCL11BQ9C0K0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
BCL11BQ9C0K0 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
BCL11BQ9C0K0 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
BCL11BQ9C0K0 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BCL11BQ9C0K0 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BCL11BQ9C0K0 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BCL11BQ9C0K0 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BCL11BQ9C0K0 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BCL11BQ9C0K0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BCL11BQ9C0K0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BCL11BQ9C0K0 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BCL11BQ9C0K0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BCL11BQ9C0K0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BCL11BQ9C0K0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BCL11BQ9C0K0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BCL11BQ9C0K0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BCL11BQ9C0K0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BCL11BQ9C0K0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BCL11BQ9C0K0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BCL11BQ9C0K0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BCL11BQ9C0K0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BCL11BQ9C0K0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BCL11BQ9C0K0 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BCL11BQ9C0K0 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BCL11BQ9C0K0 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BCL11BQ9C0K0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BCL11BQ9C0K0 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
BCL11BQ9C0K0 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
BCL11BQ9C0K0 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BCL11BQ9C0K0 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
BCL11BQ9C0K0 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BCL11BQ9C0K0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BCL11BQ9C0K0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BCL11BQ9C0K0 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms