Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CNTNAP4Q9C0A0 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CNTNAP4Q9C0A0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNTNAP4Q9C0A0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNTNAP4Q9C0A0 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNTNAP4Q9C0A0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CNTNAP4Q9C0A0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNTNAP4Q9C0A0 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNTNAP4Q9C0A0 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNTNAP4Q9C0A0 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNTNAP4Q9C0A0 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNTNAP4Q9C0A0 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNTNAP4Q9C0A0 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNTNAP4Q9C0A0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNTNAP4Q9C0A0 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNTNAP4Q9C0A0 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNTNAP4Q9C0A0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNTNAP4Q9C0A0 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNTNAP4Q9C0A0 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNTNAP4Q9C0A0 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNTNAP4Q9C0A0 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNTNAP4Q9C0A0 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNTNAP4Q9C0A0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNTNAP4Q9C0A0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNTNAP4Q9C0A0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNTNAP4Q9C0A0 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNTNAP4Q9C0A0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNTNAP4Q9C0A0 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNTNAP4Q9C0A0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNTNAP4Q9C0A0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNTNAP4Q9C0A0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNTNAP4Q9C0A0 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNTNAP4Q9C0A0 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CNTNAP4Q9C0A0 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNTNAP4Q9C0A0 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNTNAP4Q9C0A0 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNTNAP4Q9C0A0 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNTNAP4Q9C0A0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNTNAP4Q9C0A0 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNTNAP4Q9C0A0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNTNAP4Q9C0A0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNTNAP4Q9C0A0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNTNAP4Q9C0A0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNTNAP4Q9C0A0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNTNAP4Q9C0A0 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNTNAP4Q9C0A0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNTNAP4Q9C0A0 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNTNAP4Q9C0A0 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNTNAP4Q9C0A0 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNTNAP4Q9C0A0 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNTNAP4Q9C0A0 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNTNAP4Q9C0A0 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNTNAP4Q9C0A0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNTNAP4Q9C0A0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNTNAP4Q9C0A0 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNTNAP4Q9C0A0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNTNAP4Q9C0A0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNTNAP4Q9C0A0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNTNAP4Q9C0A0 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNTNAP4Q9C0A0 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNTNAP4Q9C0A0 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNTNAP4Q9C0A0 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNTNAP4Q9C0A0 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNTNAP4Q9C0A0 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNTNAP4Q9C0A0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNTNAP4Q9C0A0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNTNAP4Q9C0A0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNTNAP4Q9C0A0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNTNAP4Q9C0A0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNTNAP4Q9C0A0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNTNAP4Q9C0A0 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNTNAP4Q9C0A0 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNTNAP4Q9C0A0 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CNTNAP4Q9C0A0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNTNAP4Q9C0A0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNTNAP4Q9C0A0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms