Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM4Q9C037 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM4Q9C037 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM4Q9C037 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM4Q9C037 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM4Q9C037 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM4Q9C037 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM4Q9C037 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM4Q9C037 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM4Q9C037 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM4Q9C037 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM4Q9C037 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM4Q9C037 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM4Q9C037 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM4Q9C037 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM4Q9C037 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM4Q9C037 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM4Q9C037 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM4Q9C037 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM4Q9C037 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM4Q9C037 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM4Q9C037 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM4Q9C037 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM4Q9C037 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM4Q9C037 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM4Q9C037 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM4Q9C037 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM4Q9C037 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM4Q9C037 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM4Q9C037 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM4Q9C037 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM4Q9C037 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM4Q9C037 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM4Q9C037 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM4Q9C037 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM4Q9C037 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM4Q9C037 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM4Q9C037 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM4Q9C037 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM4Q9C037 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM4Q9C037 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM4Q9C037 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM4Q9C037 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM4Q9C037 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM4Q9C037 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM4Q9C037 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM4Q9C037 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM4Q9C037 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM4Q9C037 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM4Q9C037 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM4Q9C037 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM4Q9C037 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM4Q9C037 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM4Q9C037 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM4Q9C037 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM4Q9C037 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM4Q9C037 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM4Q9C037 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM4Q9C037 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM4Q9C037 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM4Q9C037 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM4Q9C037 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM4Q9C037 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM4Q9C037 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM4Q9C037 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM4Q9C037 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM4Q9C037 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM4Q9C037 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM4Q9C037 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM4Q9C037 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM4Q9C037 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM4Q9C037 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM4Q9C037 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM4Q9C037 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM4Q9C037 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM4Q9C037 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM4Q9C037 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM4Q9C037 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM4Q9C037 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM4Q9C037 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM4Q9C037 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM4Q9C037 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM4Q9C037 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM4Q9C037 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM4Q9C037 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM4Q9C037 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM4Q9C037 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM4Q9C037 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms