Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ19

ANKRD60, Ankyrin repeat domain-containing protein 60, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD60Q9BZ19 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD60Q9BZ19 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms