Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TRIM55Q9BYV6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms