Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY65

NPCDR1, Nasopharyngeal carcinoma down-regulated gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPCDR1Q9BY65 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NPCDR1Q9BY65 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NPCDR1Q9BY65 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NPCDR1Q9BY65 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NPCDR1Q9BY65 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NPCDR1Q9BY65 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NPCDR1Q9BY65 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NPCDR1Q9BY65 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NPCDR1Q9BY65 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NPCDR1Q9BY65 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NPCDR1Q9BY65 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NPCDR1Q9BY65 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NPCDR1Q9BY65 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NPCDR1Q9BY65 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NPCDR1Q9BY65 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NPCDR1Q9BY65 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NPCDR1Q9BY65 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NPCDR1Q9BY65 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NPCDR1Q9BY65 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NPCDR1Q9BY65 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NPCDR1Q9BY65 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NPCDR1Q9BY65 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NPCDR1Q9BY65 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NPCDR1Q9BY65 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPCDR1Q9BY65 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPCDR1Q9BY65 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPCDR1Q9BY65 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPCDR1Q9BY65 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPCDR1Q9BY65 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPCDR1Q9BY65 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPCDR1Q9BY65 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPCDR1Q9BY65 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPCDR1Q9BY65 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPCDR1Q9BY65 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NPCDR1Q9BY65 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPCDR1Q9BY65 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPCDR1Q9BY65 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NPCDR1Q9BY65 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPCDR1Q9BY65 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPCDR1Q9BY65 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPCDR1Q9BY65 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPCDR1Q9BY65 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPCDR1Q9BY65 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPCDR1Q9BY65 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPCDR1Q9BY65 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPCDR1Q9BY65 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPCDR1Q9BY65 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPCDR1Q9BY65 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPCDR1Q9BY65 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NPCDR1Q9BY65 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPCDR1Q9BY65 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPCDR1Q9BY65 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPCDR1Q9BY65 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPCDR1Q9BY65 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPCDR1Q9BY65 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPCDR1Q9BY65 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPCDR1Q9BY65 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPCDR1Q9BY65 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPCDR1Q9BY65 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPCDR1Q9BY65 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPCDR1Q9BY65 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPCDR1Q9BY65 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPCDR1Q9BY65 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPCDR1Q9BY65 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPCDR1Q9BY65 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPCDR1Q9BY65 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPCDR1Q9BY65 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPCDR1Q9BY65 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPCDR1Q9BY65 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPCDR1Q9BY65 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPCDR1Q9BY65 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPCDR1Q9BY65 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPCDR1Q9BY65 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPCDR1Q9BY65 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPCDR1Q9BY65 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPCDR1Q9BY65 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPCDR1Q9BY65 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPCDR1Q9BY65 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPCDR1Q9BY65 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPCDR1Q9BY65 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPCDR1Q9BY65 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPCDR1Q9BY65 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPCDR1Q9BY65 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPCDR1Q9BY65 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPCDR1Q9BY65 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPCDR1Q9BY65 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPCDR1Q9BY65 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPCDR1Q9BY65 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NPCDR1Q9BY65 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPCDR1Q9BY65 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPCDR1Q9BY65 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPCDR1Q9BY65 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPCDR1Q9BY65 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPCDR1Q9BY65 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPCDR1Q9BY65 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPCDR1Q9BY65 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPCDR1Q9BY65 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPCDR1Q9BY65 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPCDR1Q9BY65 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPCDR1Q9BY65 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms