Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
MCMBPQ9BTE3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCMBPQ9BTE3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms