Protein–RNA interactions for Protein: Q99607

ELF4, ETS-related transcription factor Elf-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF4Q99607 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ELF4Q99607 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ELF4Q99607 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ELF4Q99607 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ELF4Q99607 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ELF4Q99607 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ELF4Q99607 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ELF4Q99607 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ELF4Q99607 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ELF4Q99607 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ELF4Q99607 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ELF4Q99607 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ELF4Q99607 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ELF4Q99607 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ELF4Q99607 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ELF4Q99607 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ELF4Q99607 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELF4Q99607 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELF4Q99607 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELF4Q99607 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELF4Q99607 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELF4Q99607 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELF4Q99607 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELF4Q99607 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELF4Q99607 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ELF4Q99607 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELF4Q99607 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELF4Q99607 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELF4Q99607 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ELF4Q99607 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELF4Q99607 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELF4Q99607 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELF4Q99607 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ELF4Q99607 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ELF4Q99607 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ELF4Q99607 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ELF4Q99607 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ELF4Q99607 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ELF4Q99607 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ELF4Q99607 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ELF4Q99607 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ELF4Q99607 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ELF4Q99607 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ELF4Q99607 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ELF4Q99607 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ELF4Q99607 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ELF4Q99607 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ELF4Q99607 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ELF4Q99607 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ELF4Q99607 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ELF4Q99607 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ELF4Q99607 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ELF4Q99607 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ELF4Q99607 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ELF4Q99607 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ELF4Q99607 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ELF4Q99607 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ELF4Q99607 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELF4Q99607 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELF4Q99607 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELF4Q99607 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELF4Q99607 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELF4Q99607 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELF4Q99607 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELF4Q99607 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELF4Q99607 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELF4Q99607 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELF4Q99607 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELF4Q99607 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELF4Q99607 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELF4Q99607 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELF4Q99607 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ELF4Q99607 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ELF4Q99607 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ELF4Q99607 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ELF4Q99607 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ELF4Q99607 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ELF4Q99607 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ELF4Q99607 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ELF4Q99607 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ELF4Q99607 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ELF4Q99607 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ELF4Q99607 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ELF4Q99607 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ELF4Q99607 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ELF4Q99607 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ELF4Q99607 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ELF4Q99607 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ELF4Q99607 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ELF4Q99607 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ELF4Q99607 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ELF4Q99607 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ELF4Q99607 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ELF4Q99607 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ELF4Q99607 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ELF4Q99607 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ELF4Q99607 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ELF4Q99607 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ELF4Q99607 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ELF4Q99607 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms