Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VAT1Q99536 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms