Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SIN3AQ96ST3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SIN3AQ96ST3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SIN3AQ96ST3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
SIN3AQ96ST3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SIN3AQ96ST3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SIN3AQ96ST3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SIN3AQ96ST3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SIN3AQ96ST3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SIN3AQ96ST3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SIN3AQ96ST3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SIN3AQ96ST3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SIN3AQ96ST3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
SIN3AQ96ST3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SIN3AQ96ST3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SIN3AQ96ST3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SIN3AQ96ST3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SIN3AQ96ST3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SIN3AQ96ST3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SIN3AQ96ST3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SIN3AQ96ST3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SIN3AQ96ST3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SIN3AQ96ST3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SIN3AQ96ST3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SIN3AQ96ST3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SIN3AQ96ST3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SIN3AQ96ST3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SIN3AQ96ST3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SIN3AQ96ST3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SIN3AQ96ST3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SIN3AQ96ST3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
SIN3AQ96ST3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
SIN3AQ96ST3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SIN3AQ96ST3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SIN3AQ96ST3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SIN3AQ96ST3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SIN3AQ96ST3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
SIN3AQ96ST3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SIN3AQ96ST3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SIN3AQ96ST3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SIN3AQ96ST3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SIN3AQ96ST3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SIN3AQ96ST3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SIN3AQ96ST3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SIN3AQ96ST3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SIN3AQ96ST3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SIN3AQ96ST3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SIN3AQ96ST3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SIN3AQ96ST3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SIN3AQ96ST3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SIN3AQ96ST3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SIN3AQ96ST3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SIN3AQ96ST3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SIN3AQ96ST3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SIN3AQ96ST3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SIN3AQ96ST3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SIN3AQ96ST3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SIN3AQ96ST3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SIN3AQ96ST3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SIN3AQ96ST3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SIN3AQ96ST3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
SIN3AQ96ST3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
SIN3AQ96ST3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
SIN3AQ96ST3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SIN3AQ96ST3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
SIN3AQ96ST3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SIN3AQ96ST3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SIN3AQ96ST3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SIN3AQ96ST3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
SIN3AQ96ST3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SIN3AQ96ST3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SIN3AQ96ST3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SIN3AQ96ST3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SIN3AQ96ST3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SIN3AQ96ST3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
SIN3AQ96ST3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SIN3AQ96ST3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SIN3AQ96ST3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SIN3AQ96ST3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SIN3AQ96ST3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SIN3AQ96ST3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SIN3AQ96ST3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SIN3AQ96ST3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SIN3AQ96ST3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SIN3AQ96ST3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SIN3AQ96ST3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
SIN3AQ96ST3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SIN3AQ96ST3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SIN3AQ96ST3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
SIN3AQ96ST3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SIN3AQ96ST3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SIN3AQ96ST3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SIN3AQ96ST3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SIN3AQ96ST3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SIN3AQ96ST3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SIN3AQ96ST3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SIN3AQ96ST3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SIN3AQ96ST3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SIN3AQ96ST3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SIN3AQ96ST3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms