Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms