Protein–RNA interactions for Protein: Q96NF6

C8orf49, Putative uncharacterized protein C8orf49, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf49Q96NF6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf49Q96NF6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf49Q96NF6 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms