Protein–RNA interactions for Protein: Q96MM3

ZFP42, Zinc finger protein 42 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFP42Q96MM3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZFP42Q96MM3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZFP42Q96MM3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZFP42Q96MM3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ZFP42Q96MM3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZFP42Q96MM3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZFP42Q96MM3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZFP42Q96MM3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZFP42Q96MM3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZFP42Q96MM3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZFP42Q96MM3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZFP42Q96MM3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZFP42Q96MM3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZFP42Q96MM3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZFP42Q96MM3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZFP42Q96MM3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZFP42Q96MM3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZFP42Q96MM3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZFP42Q96MM3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ZFP42Q96MM3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZFP42Q96MM3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZFP42Q96MM3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZFP42Q96MM3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZFP42Q96MM3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZFP42Q96MM3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZFP42Q96MM3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZFP42Q96MM3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZFP42Q96MM3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZFP42Q96MM3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZFP42Q96MM3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZFP42Q96MM3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZFP42Q96MM3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZFP42Q96MM3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZFP42Q96MM3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZFP42Q96MM3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZFP42Q96MM3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZFP42Q96MM3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZFP42Q96MM3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZFP42Q96MM3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZFP42Q96MM3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZFP42Q96MM3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZFP42Q96MM3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZFP42Q96MM3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZFP42Q96MM3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms