Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CAPNS2Q96L46 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CAPNS2Q96L46 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms