Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK5RAP3Q96JB5 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms