Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CENPNQ96H22 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CENPNQ96H22 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CENPNQ96H22 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CENPNQ96H22 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CENPNQ96H22 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CENPNQ96H22 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CENPNQ96H22 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CENPNQ96H22 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms