Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY0

ZC2HC1A, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC2HC1AQ96GY0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZC2HC1AQ96GY0 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms