Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LTV1Q96GA3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LTV1Q96GA3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LTV1Q96GA3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LTV1Q96GA3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LTV1Q96GA3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LTV1Q96GA3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LTV1Q96GA3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LTV1Q96GA3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LTV1Q96GA3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LTV1Q96GA3 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LTV1Q96GA3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LTV1Q96GA3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LTV1Q96GA3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LTV1Q96GA3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LTV1Q96GA3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LTV1Q96GA3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LTV1Q96GA3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LTV1Q96GA3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LTV1Q96GA3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LTV1Q96GA3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LTV1Q96GA3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LTV1Q96GA3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LTV1Q96GA3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LTV1Q96GA3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LTV1Q96GA3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LTV1Q96GA3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LTV1Q96GA3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
LTV1Q96GA3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LTV1Q96GA3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LTV1Q96GA3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LTV1Q96GA3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LTV1Q96GA3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LTV1Q96GA3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LTV1Q96GA3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
LTV1Q96GA3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LTV1Q96GA3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LTV1Q96GA3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LTV1Q96GA3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LTV1Q96GA3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LTV1Q96GA3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LTV1Q96GA3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LTV1Q96GA3 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LTV1Q96GA3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LTV1Q96GA3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LTV1Q96GA3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LTV1Q96GA3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LTV1Q96GA3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
LTV1Q96GA3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LTV1Q96GA3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LTV1Q96GA3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LTV1Q96GA3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LTV1Q96GA3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
LTV1Q96GA3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LTV1Q96GA3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LTV1Q96GA3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LTV1Q96GA3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LTV1Q96GA3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LTV1Q96GA3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LTV1Q96GA3 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LTV1Q96GA3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LTV1Q96GA3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LTV1Q96GA3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LTV1Q96GA3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LTV1Q96GA3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LTV1Q96GA3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LTV1Q96GA3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LTV1Q96GA3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LTV1Q96GA3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LTV1Q96GA3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms