Protein–RNA interactions for Protein: Q96BW1

UPRT, Uracil phosphoribosyltransferase homolog, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPRTQ96BW1 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UPRTQ96BW1 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UPRTQ96BW1 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms