Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
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RABGGTAQ92696 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RABGGTAQ92696 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RABGGTAQ92696 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
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