Protein–RNA interactions for Protein: Q92560

BAP1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase BAP1, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BAP1Q92560 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BAP1Q92560 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BAP1Q92560 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BAP1Q92560 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BAP1Q92560 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BAP1Q92560 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BAP1Q92560 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BAP1Q92560 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BAP1Q92560 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BAP1Q92560 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BAP1Q92560 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BAP1Q92560 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BAP1Q92560 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BAP1Q92560 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BAP1Q92560 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BAP1Q92560 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BAP1Q92560 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BAP1Q92560 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BAP1Q92560 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BAP1Q92560 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BAP1Q92560 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BAP1Q92560 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BAP1Q92560 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BAP1Q92560 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BAP1Q92560 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BAP1Q92560 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BAP1Q92560 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BAP1Q92560 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BAP1Q92560 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BAP1Q92560 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BAP1Q92560 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BAP1Q92560 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BAP1Q92560 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BAP1Q92560 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BAP1Q92560 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BAP1Q92560 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BAP1Q92560 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BAP1Q92560 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BAP1Q92560 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BAP1Q92560 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BAP1Q92560 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BAP1Q92560 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BAP1Q92560 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BAP1Q92560 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BAP1Q92560 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BAP1Q92560 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BAP1Q92560 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BAP1Q92560 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BAP1Q92560 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BAP1Q92560 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BAP1Q92560 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BAP1Q92560 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BAP1Q92560 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BAP1Q92560 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BAP1Q92560 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BAP1Q92560 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BAP1Q92560 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BAP1Q92560 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BAP1Q92560 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BAP1Q92560 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BAP1Q92560 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BAP1Q92560 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BAP1Q92560 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BAP1Q92560 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BAP1Q92560 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BAP1Q92560 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BAP1Q92560 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BAP1Q92560 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BAP1Q92560 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BAP1Q92560 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BAP1Q92560 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BAP1Q92560 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BAP1Q92560 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BAP1Q92560 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BAP1Q92560 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BAP1Q92560 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BAP1Q92560 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BAP1Q92560 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BAP1Q92560 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BAP1Q92560 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BAP1Q92560 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BAP1Q92560 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BAP1Q92560 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BAP1Q92560 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BAP1Q92560 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BAP1Q92560 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BAP1Q92560 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BAP1Q92560 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BAP1Q92560 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BAP1Q92560 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BAP1Q92560 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BAP1Q92560 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BAP1Q92560 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BAP1Q92560 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BAP1Q92560 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BAP1Q92560 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BAP1Q92560 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BAP1Q92560 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BAP1Q92560 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BAP1Q92560 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms