Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms