Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
HELBQ8NG08 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HELBQ8NG08 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HELBQ8NG08 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HELBQ8NG08 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HELBQ8NG08 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HELBQ8NG08 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HELBQ8NG08 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HELBQ8NG08 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HELBQ8NG08 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HELBQ8NG08 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HELBQ8NG08 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HELBQ8NG08 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
HELBQ8NG08 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HELBQ8NG08 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HELBQ8NG08 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HELBQ8NG08 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HELBQ8NG08 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HELBQ8NG08 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HELBQ8NG08 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HELBQ8NG08 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HELBQ8NG08 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HELBQ8NG08 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HELBQ8NG08 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HELBQ8NG08 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HELBQ8NG08 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HELBQ8NG08 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HELBQ8NG08 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HELBQ8NG08 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HELBQ8NG08 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HELBQ8NG08 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HELBQ8NG08 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HELBQ8NG08 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HELBQ8NG08 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HELBQ8NG08 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HELBQ8NG08 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HELBQ8NG08 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HELBQ8NG08 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HELBQ8NG08 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HELBQ8NG08 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HELBQ8NG08 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HELBQ8NG08 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HELBQ8NG08 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HELBQ8NG08 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HELBQ8NG08 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HELBQ8NG08 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HELBQ8NG08 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HELBQ8NG08 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms