Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYRIPQ8NFW9 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYRIPQ8NFW9 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms