Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU4

CCDC191, Coiled-coil domain-containing protein 191, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC191Q8NCU4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC191Q8NCU4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC191Q8NCU4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC191Q8NCU4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC191Q8NCU4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC191Q8NCU4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC191Q8NCU4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC191Q8NCU4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC191Q8NCU4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC191Q8NCU4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC191Q8NCU4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC191Q8NCU4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC191Q8NCU4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC191Q8NCU4 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC191Q8NCU4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC191Q8NCU4 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC191Q8NCU4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC191Q8NCU4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC191Q8NCU4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC191Q8NCU4 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC191Q8NCU4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC191Q8NCU4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC191Q8NCU4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC191Q8NCU4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC191Q8NCU4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC191Q8NCU4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC191Q8NCU4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC191Q8NCU4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC191Q8NCU4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC191Q8NCU4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC191Q8NCU4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC191Q8NCU4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC191Q8NCU4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC191Q8NCU4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC191Q8NCU4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC191Q8NCU4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC191Q8NCU4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC191Q8NCU4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC191Q8NCU4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC191Q8NCU4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC191Q8NCU4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC191Q8NCU4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC191Q8NCU4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC191Q8NCU4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC191Q8NCU4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC191Q8NCU4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC191Q8NCU4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC191Q8NCU4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC191Q8NCU4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC191Q8NCU4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC191Q8NCU4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC191Q8NCU4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC191Q8NCU4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC191Q8NCU4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC191Q8NCU4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC191Q8NCU4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC191Q8NCU4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC191Q8NCU4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC191Q8NCU4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC191Q8NCU4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC191Q8NCU4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC191Q8NCU4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC191Q8NCU4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC191Q8NCU4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC191Q8NCU4 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC191Q8NCU4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC191Q8NCU4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC191Q8NCU4 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC191Q8NCU4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC191Q8NCU4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC191Q8NCU4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC191Q8NCU4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC191Q8NCU4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC191Q8NCU4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC191Q8NCU4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC191Q8NCU4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC191Q8NCU4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC191Q8NCU4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC191Q8NCU4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC191Q8NCU4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC191Q8NCU4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC191Q8NCU4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC191Q8NCU4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC191Q8NCU4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC191Q8NCU4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC191Q8NCU4 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC191Q8NCU4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC191Q8NCU4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC191Q8NCU4 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC191Q8NCU4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC191Q8NCU4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC191Q8NCU4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC191Q8NCU4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC191Q8NCU4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC191Q8NCU4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC191Q8NCU4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC191Q8NCU4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC191Q8NCU4 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC191Q8NCU4 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC191Q8NCU4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 202.5 ms