Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC06

ACBD4, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACBD4Q8NC06 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACBD4Q8NC06 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ACBD4Q8NC06 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACBD4Q8NC06 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACBD4Q8NC06 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACBD4Q8NC06 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACBD4Q8NC06 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACBD4Q8NC06 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACBD4Q8NC06 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACBD4Q8NC06 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACBD4Q8NC06 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACBD4Q8NC06 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACBD4Q8NC06 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACBD4Q8NC06 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACBD4Q8NC06 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ACBD4Q8NC06 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACBD4Q8NC06 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACBD4Q8NC06 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACBD4Q8NC06 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ACBD4Q8NC06 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ACBD4Q8NC06 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ACBD4Q8NC06 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ACBD4Q8NC06 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACBD4Q8NC06 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACBD4Q8NC06 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACBD4Q8NC06 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACBD4Q8NC06 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACBD4Q8NC06 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACBD4Q8NC06 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACBD4Q8NC06 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACBD4Q8NC06 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACBD4Q8NC06 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACBD4Q8NC06 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACBD4Q8NC06 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACBD4Q8NC06 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACBD4Q8NC06 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACBD4Q8NC06 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACBD4Q8NC06 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACBD4Q8NC06 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACBD4Q8NC06 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACBD4Q8NC06 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACBD4Q8NC06 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACBD4Q8NC06 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ACBD4Q8NC06 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACBD4Q8NC06 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACBD4Q8NC06 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACBD4Q8NC06 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACBD4Q8NC06 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ACBD4Q8NC06 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACBD4Q8NC06 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACBD4Q8NC06 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACBD4Q8NC06 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACBD4Q8NC06 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACBD4Q8NC06 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACBD4Q8NC06 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACBD4Q8NC06 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACBD4Q8NC06 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACBD4Q8NC06 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACBD4Q8NC06 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACBD4Q8NC06 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACBD4Q8NC06 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACBD4Q8NC06 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ACBD4Q8NC06 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACBD4Q8NC06 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACBD4Q8NC06 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACBD4Q8NC06 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACBD4Q8NC06 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACBD4Q8NC06 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACBD4Q8NC06 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ACBD4Q8NC06 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACBD4Q8NC06 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACBD4Q8NC06 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACBD4Q8NC06 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACBD4Q8NC06 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACBD4Q8NC06 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACBD4Q8NC06 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACBD4Q8NC06 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACBD4Q8NC06 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACBD4Q8NC06 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACBD4Q8NC06 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACBD4Q8NC06 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACBD4Q8NC06 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACBD4Q8NC06 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACBD4Q8NC06 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACBD4Q8NC06 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACBD4Q8NC06 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACBD4Q8NC06 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACBD4Q8NC06 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACBD4Q8NC06 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACBD4Q8NC06 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACBD4Q8NC06 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACBD4Q8NC06 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACBD4Q8NC06 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACBD4Q8NC06 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACBD4Q8NC06 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACBD4Q8NC06 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACBD4Q8NC06 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACBD4Q8NC06 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACBD4Q8NC06 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACBD4Q8NC06 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms