Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF2

NHLRC2, NHL repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC2Q8NBF2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NHLRC2Q8NBF2 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NHLRC2Q8NBF2 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NHLRC2Q8NBF2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NHLRC2Q8NBF2 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NHLRC2Q8NBF2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NHLRC2Q8NBF2 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NHLRC2Q8NBF2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NHLRC2Q8NBF2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NHLRC2Q8NBF2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NHLRC2Q8NBF2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NHLRC2Q8NBF2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NHLRC2Q8NBF2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NHLRC2Q8NBF2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NHLRC2Q8NBF2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NHLRC2Q8NBF2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NHLRC2Q8NBF2 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NHLRC2Q8NBF2 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NHLRC2Q8NBF2 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NHLRC2Q8NBF2 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NHLRC2Q8NBF2 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NHLRC2Q8NBF2 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NHLRC2Q8NBF2 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NHLRC2Q8NBF2 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NHLRC2Q8NBF2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NHLRC2Q8NBF2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NHLRC2Q8NBF2 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NHLRC2Q8NBF2 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NHLRC2Q8NBF2 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NHLRC2Q8NBF2 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NHLRC2Q8NBF2 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NHLRC2Q8NBF2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NHLRC2Q8NBF2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NHLRC2Q8NBF2 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NHLRC2Q8NBF2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NHLRC2Q8NBF2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NHLRC2Q8NBF2 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NHLRC2Q8NBF2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NHLRC2Q8NBF2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NHLRC2Q8NBF2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NHLRC2Q8NBF2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NHLRC2Q8NBF2 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NHLRC2Q8NBF2 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NHLRC2Q8NBF2 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NHLRC2Q8NBF2 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NHLRC2Q8NBF2 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NHLRC2Q8NBF2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NHLRC2Q8NBF2 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms