Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FSIP1Q8NA03 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms