Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8I0

SAMD12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD12Q8N8I0 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAMD12Q8N8I0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAMD12Q8N8I0 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAMD12Q8N8I0 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAMD12Q8N8I0 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAMD12Q8N8I0 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAMD12Q8N8I0 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAMD12Q8N8I0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAMD12Q8N8I0 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAMD12Q8N8I0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAMD12Q8N8I0 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAMD12Q8N8I0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAMD12Q8N8I0 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SAMD12Q8N8I0 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SAMD12Q8N8I0 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAMD12Q8N8I0 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAMD12Q8N8I0 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAMD12Q8N8I0 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAMD12Q8N8I0 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAMD12Q8N8I0 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAMD12Q8N8I0 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAMD12Q8N8I0 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAMD12Q8N8I0 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAMD12Q8N8I0 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAMD12Q8N8I0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAMD12Q8N8I0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAMD12Q8N8I0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SAMD12Q8N8I0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SAMD12Q8N8I0 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAMD12Q8N8I0 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAMD12Q8N8I0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAMD12Q8N8I0 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAMD12Q8N8I0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAMD12Q8N8I0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAMD12Q8N8I0 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAMD12Q8N8I0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAMD12Q8N8I0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAMD12Q8N8I0 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAMD12Q8N8I0 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SAMD12Q8N8I0 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAMD12Q8N8I0 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAMD12Q8N8I0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAMD12Q8N8I0 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAMD12Q8N8I0 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAMD12Q8N8I0 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAMD12Q8N8I0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAMD12Q8N8I0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SAMD12Q8N8I0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SAMD12Q8N8I0 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAMD12Q8N8I0 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAMD12Q8N8I0 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAMD12Q8N8I0 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAMD12Q8N8I0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAMD12Q8N8I0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAMD12Q8N8I0 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAMD12Q8N8I0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAMD12Q8N8I0 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAMD12Q8N8I0 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAMD12Q8N8I0 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAMD12Q8N8I0 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SAMD12Q8N8I0 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAMD12Q8N8I0 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAMD12Q8N8I0 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAMD12Q8N8I0 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAMD12Q8N8I0 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SAMD12Q8N8I0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAMD12Q8N8I0 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAMD12Q8N8I0 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAMD12Q8N8I0 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAMD12Q8N8I0 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAMD12Q8N8I0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SAMD12Q8N8I0 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAMD12Q8N8I0 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAMD12Q8N8I0 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAMD12Q8N8I0 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SAMD12Q8N8I0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAMD12Q8N8I0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAMD12Q8N8I0 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAMD12Q8N8I0 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SAMD12Q8N8I0 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SAMD12Q8N8I0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SAMD12Q8N8I0 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SAMD12Q8N8I0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SAMD12Q8N8I0 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SAMD12Q8N8I0 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SAMD12Q8N8I0 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SAMD12Q8N8I0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SAMD12Q8N8I0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SAMD12Q8N8I0 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms