Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CHCHD4Q8N4Q1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
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