Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SVBPQ8N300 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SVBPQ8N300 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SVBPQ8N300 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SVBPQ8N300 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SVBPQ8N300 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SVBPQ8N300 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SVBPQ8N300 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SVBPQ8N300 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SVBPQ8N300 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SVBPQ8N300 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SVBPQ8N300 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SVBPQ8N300 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SVBPQ8N300 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SVBPQ8N300 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SVBPQ8N300 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SVBPQ8N300 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SVBPQ8N300 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SVBPQ8N300 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SVBPQ8N300 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SVBPQ8N300 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SVBPQ8N300 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SVBPQ8N300 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SVBPQ8N300 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SVBPQ8N300 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SVBPQ8N300 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SVBPQ8N300 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SVBPQ8N300 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SVBPQ8N300 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SVBPQ8N300 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SVBPQ8N300 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SVBPQ8N300 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SVBPQ8N300 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SVBPQ8N300 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SVBPQ8N300 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SVBPQ8N300 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SVBPQ8N300 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SVBPQ8N300 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SVBPQ8N300 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SVBPQ8N300 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SVBPQ8N300 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SVBPQ8N300 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SVBPQ8N300 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SVBPQ8N300 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SVBPQ8N300 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SVBPQ8N300 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SVBPQ8N300 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SVBPQ8N300 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SVBPQ8N300 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SVBPQ8N300 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SVBPQ8N300 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SVBPQ8N300 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SVBPQ8N300 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SVBPQ8N300 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SVBPQ8N300 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SVBPQ8N300 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SVBPQ8N300 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SVBPQ8N300 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SVBPQ8N300 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SVBPQ8N300 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SVBPQ8N300 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SVBPQ8N300 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SVBPQ8N300 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SVBPQ8N300 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SVBPQ8N300 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SVBPQ8N300 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SVBPQ8N300 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SVBPQ8N300 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SVBPQ8N300 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SVBPQ8N300 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SVBPQ8N300 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SVBPQ8N300 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SVBPQ8N300 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms