Protein–RNA interactions for Protein: Q8N271

PROM2, Prominin-2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM2Q8N271 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PROM2Q8N271 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PROM2Q8N271 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PROM2Q8N271 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PROM2Q8N271 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PROM2Q8N271 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PROM2Q8N271 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PROM2Q8N271 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PROM2Q8N271 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PROM2Q8N271 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PROM2Q8N271 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PROM2Q8N271 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PROM2Q8N271 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PROM2Q8N271 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PROM2Q8N271 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PROM2Q8N271 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PROM2Q8N271 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PROM2Q8N271 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PROM2Q8N271 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PROM2Q8N271 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PROM2Q8N271 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PROM2Q8N271 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PROM2Q8N271 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PROM2Q8N271 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PROM2Q8N271 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PROM2Q8N271 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PROM2Q8N271 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PROM2Q8N271 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PROM2Q8N271 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PROM2Q8N271 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PROM2Q8N271 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PROM2Q8N271 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PROM2Q8N271 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PROM2Q8N271 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PROM2Q8N271 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PROM2Q8N271 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PROM2Q8N271 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PROM2Q8N271 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PROM2Q8N271 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PROM2Q8N271 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PROM2Q8N271 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PROM2Q8N271 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PROM2Q8N271 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PROM2Q8N271 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PROM2Q8N271 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PROM2Q8N271 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PROM2Q8N271 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PROM2Q8N271 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PROM2Q8N271 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PROM2Q8N271 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PROM2Q8N271 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PROM2Q8N271 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PROM2Q8N271 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PROM2Q8N271 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PROM2Q8N271 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PROM2Q8N271 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PROM2Q8N271 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PROM2Q8N271 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PROM2Q8N271 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PROM2Q8N271 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PROM2Q8N271 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PROM2Q8N271 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PROM2Q8N271 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PROM2Q8N271 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PROM2Q8N271 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PROM2Q8N271 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PROM2Q8N271 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PROM2Q8N271 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PROM2Q8N271 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PROM2Q8N271 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PROM2Q8N271 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PROM2Q8N271 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PROM2Q8N271 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PROM2Q8N271 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PROM2Q8N271 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PROM2Q8N271 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PROM2Q8N271 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PROM2Q8N271 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PROM2Q8N271 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PROM2Q8N271 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PROM2Q8N271 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PROM2Q8N271 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PROM2Q8N271 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PROM2Q8N271 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PROM2Q8N271 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PROM2Q8N271 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PROM2Q8N271 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PROM2Q8N271 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PROM2Q8N271 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PROM2Q8N271 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PROM2Q8N271 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PROM2Q8N271 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PROM2Q8N271 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PROM2Q8N271 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PROM2Q8N271 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PROM2Q8N271 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PROM2Q8N271 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PROM2Q8N271 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PROM2Q8N271 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PROM2Q8N271 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms