Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPC2Q8N158 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPC2Q8N158 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPC2Q8N158 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPC2Q8N158 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPC2Q8N158 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPC2Q8N158 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPC2Q8N158 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPC2Q8N158 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPC2Q8N158 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPC2Q8N158 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPC2Q8N158 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPC2Q8N158 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPC2Q8N158 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPC2Q8N158 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPC2Q8N158 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPC2Q8N158 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPC2Q8N158 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPC2Q8N158 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPC2Q8N158 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPC2Q8N158 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPC2Q8N158 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPC2Q8N158 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPC2Q8N158 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPC2Q8N158 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPC2Q8N158 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPC2Q8N158 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPC2Q8N158 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPC2Q8N158 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GPC2Q8N158 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPC2Q8N158 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPC2Q8N158 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GPC2Q8N158 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GPC2Q8N158 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPC2Q8N158 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPC2Q8N158 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPC2Q8N158 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPC2Q8N158 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPC2Q8N158 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPC2Q8N158 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPC2Q8N158 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPC2Q8N158 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPC2Q8N158 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPC2Q8N158 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPC2Q8N158 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPC2Q8N158 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPC2Q8N158 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPC2Q8N158 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPC2Q8N158 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPC2Q8N158 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPC2Q8N158 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPC2Q8N158 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPC2Q8N158 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPC2Q8N158 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPC2Q8N158 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GPC2Q8N158 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPC2Q8N158 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPC2Q8N158 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPC2Q8N158 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPC2Q8N158 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPC2Q8N158 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPC2Q8N158 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPC2Q8N158 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GPC2Q8N158 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GPC2Q8N158 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GPC2Q8N158 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GPC2Q8N158 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GPC2Q8N158 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GPC2Q8N158 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GPC2Q8N158 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GPC2Q8N158 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GPC2Q8N158 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GPC2Q8N158 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GPC2Q8N158 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GPC2Q8N158 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GPC2Q8N158 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPC2Q8N158 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPC2Q8N158 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPC2Q8N158 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPC2Q8N158 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPC2Q8N158 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPC2Q8N158 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPC2Q8N158 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GPC2Q8N158 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPC2Q8N158 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPC2Q8N158 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPC2Q8N158 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPC2Q8N158 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPC2Q8N158 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPC2Q8N158 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPC2Q8N158 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPC2Q8N158 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPC2Q8N158 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPC2Q8N158 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GPC2Q8N158 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GPC2Q8N158 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPC2Q8N158 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPC2Q8N158 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GPC2Q8N158 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GPC2Q8N158 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms