Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCP3Q8IZU3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCP3Q8IZU3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms