Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXS2

CCDC65, Coiled-coil domain-containing protein 65, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC65Q8IXS2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC65Q8IXS2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC65Q8IXS2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC65Q8IXS2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC65Q8IXS2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC65Q8IXS2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC65Q8IXS2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC65Q8IXS2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC65Q8IXS2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC65Q8IXS2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms