Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXR5

FAM178B, Protein FAM178B, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM178BQ8IXR5 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM178BQ8IXR5 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM178BQ8IXR5 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM178BQ8IXR5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM178BQ8IXR5 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms