Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNMB4Q86W47 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNMB4Q86W47 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNMB4Q86W47 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNMB4Q86W47 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNMB4Q86W47 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNMB4Q86W47 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNMB4Q86W47 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNMB4Q86W47 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNMB4Q86W47 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNMB4Q86W47 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNMB4Q86W47 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNMB4Q86W47 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNMB4Q86W47 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNMB4Q86W47 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNMB4Q86W47 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNMB4Q86W47 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNMB4Q86W47 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNMB4Q86W47 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNMB4Q86W47 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNMB4Q86W47 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNMB4Q86W47 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNMB4Q86W47 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNMB4Q86W47 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNMB4Q86W47 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNMB4Q86W47 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNMB4Q86W47 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNMB4Q86W47 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNMB4Q86W47 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNMB4Q86W47 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNMB4Q86W47 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNMB4Q86W47 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNMB4Q86W47 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNMB4Q86W47 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNMB4Q86W47 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNMB4Q86W47 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNMB4Q86W47 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNMB4Q86W47 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNMB4Q86W47 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNMB4Q86W47 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNMB4Q86W47 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNMB4Q86W47 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms