Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE8

NPM2, Nucleoplasmin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM2Q86SE8 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NPM2Q86SE8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NPM2Q86SE8 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NPM2Q86SE8 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NPM2Q86SE8 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NPM2Q86SE8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NPM2Q86SE8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
NPM2Q86SE8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NPM2Q86SE8 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NPM2Q86SE8 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NPM2Q86SE8 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NPM2Q86SE8 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NPM2Q86SE8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NPM2Q86SE8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NPM2Q86SE8 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NPM2Q86SE8 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NPM2Q86SE8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NPM2Q86SE8 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NPM2Q86SE8 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NPM2Q86SE8 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms