Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z569

BRAP, BRCA1-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAPQ7Z569 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRAPQ7Z569 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRAPQ7Z569 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRAPQ7Z569 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRAPQ7Z569 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRAPQ7Z569 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRAPQ7Z569 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRAPQ7Z569 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRAPQ7Z569 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRAPQ7Z569 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRAPQ7Z569 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRAPQ7Z569 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRAPQ7Z569 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRAPQ7Z569 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRAPQ7Z569 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRAPQ7Z569 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRAPQ7Z569 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRAPQ7Z569 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRAPQ7Z569 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRAPQ7Z569 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRAPQ7Z569 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRAPQ7Z569 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRAPQ7Z569 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRAPQ7Z569 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRAPQ7Z569 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRAPQ7Z569 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRAPQ7Z569 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRAPQ7Z569 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRAPQ7Z569 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRAPQ7Z569 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRAPQ7Z569 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms