Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CACNA2D4Q7Z3S7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms